A priori, je dirais que les dumps en question ont du être mal faits à l'époque.
Sinon, pour le rom manager, tu peux essayer clear mame pro pour analyser ce qui ne va pas dans tes fichiers.
Sinon, regarde le contenu de tes roms. Si la nomenclature des fichiers à l'intérieur n'est pas du type 123-c1.bin mais d'un type bizarre du style N10234489.078 alors, procure toi cet utilitaire : redump36. Il sert à convertir les roms dans l'ancien format en le nouveau format. Ca te permettra peut-être d'en faire marcher quelques-unes de plus.