J'ai eu exactement le même problème. Le seul moyen que j'ai trouvé est d'étirer l'image dans le menu Vidéo -> Correction du ratio en plein écran -> Etirer en plein écran (ou peut-être aussi une des 2 autres options d'étirement).
Effectivement, j'ai remarqué le même problème, dès qu'on quitte l'ému, l'option se décoche. Essaie sans quitter. Par contre, avec la version 1.5.2, ça marche correctement.
Tu procèdes comment pour y jouer ? Tu vas dans le menu fichier et tu fais "run iso" ? Ou bien tu passes par un lecteur de cd virtuel ? (daemon tools, alcohol 120 %, ...) Ou bien encore utilises-tu le plugin cd mooby ?